同域共存的野生和家养动物需要面临相似的生存挑战，甚至存在竞争关系。家畜数量的持续增长对野生动物的生存是一个威胁。项目六研究团队发现肠道微生物能够反映和调节宿主动物的代谢和免疫功能，并且帮助宿主提高适应能力。在寒冷环境，哺乳动物会产生生理上的适应，肠道微生物能够促进肠道的调节和吸收能力，提高食物和能量的利用率，肠道微生物还能有利于宿主的能量补偿。鹅喉羚和绵羊是三江源国家公园同域共存的典型动物。当前野生鹅喉羚面临更严峻的生存挑战和食物竞争压力。由于人为干扰，野生鹅喉羚的食物质量远低于家养绵羊，但两物种均具有自己的适应策略。相较于野生鹅喉羚，家养绵羊的食物组成似乎能更多的为其提供能量，绵羊肠道中消化球菌科等的相对丰度高于鹅喉羚，这些菌群能够帮助宿主提高能量的利用率。而野生鹅喉羚肠道中与纤维素降解相关的微生物丰度要高于绵羊，糖代谢功能显著地高于家养绵羊，糖代谢能够为宿主提供能量，是宿主的重要能量来源，这对鹅喉羚的生存具有重要作用。成果在《Frontiers in Microbiology》（IF=4.259）上发表。

Wen Qin, Pengfei Song, Gonghua Lin, YanGan Huang, Lei Wang, Xiaowen Zhou, Shengqing Li, Tongzuo Zhang. 2020. Gut microbiota plasticity influences the adaptability of wild and domestic animals in co-inhabited areas. Frontiers in Microbiology. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.00125